我國對于外商投資企業(yè)清算流程也有這明確的規(guī)定，外商投資企業(yè)在非破產(chǎn)清算過程中，將主要涉及兩方面的稅務(wù)問題。一是清算組將負責對企業(yè)所欠繳的所有稅款進行清理和補繳，經(jīng)過核算的所欠稅款，將按照公司法規(guī)定的清償順序予以清償；二是對于在清算過程中所可能產(chǎn)生新的稅賦進行清繳。
一、經(jīng)營期間欠繳稅款的清理(一)欠繳外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅的清理
1.稅收減免期
為了更好地吸引外商投資企業(yè)，《外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅法》(簡稱《所得稅法》)中的一些稅收優(yōu)惠，比發(fā)達國家和其他部分發(fā)達國家更加優(yōu)惠，使得外商投資者普遍收益。《所得稅法》第八條對經(jīng)營期限在十年以上的外商投資企業(yè)還有兩免三減半的的優(yōu)惠，如果外商投資企業(yè)由于各種原因，實際的經(jīng)營期限少于十年，其已享受的該項所得稅減、免優(yōu)惠金額應(yīng)當補繳。
2.再投資退稅
《所得稅法》第十條規(guī)定：外商投資企業(yè)的外國投資者，將從企業(yè)取得的利潤直接再投資于該企業(yè)，增加注冊資本，或者作為資本投資開辦其他外商投資企業(yè)，經(jīng)營期不少于五年的，經(jīng)投資者申請，稅務(wù)機關(guān)批準，退還其再投資部分已繳納所得稅的40%稅款，國務(wù)院另有優(yōu)惠規(guī)定的，依照國務(wù)院的規(guī)定辦理;再投資不滿五年撤出的，應(yīng)當繳回已退的稅款。
另外，外國投資者在中國境內(nèi)直接再投資舉辦。擴建產(chǎn)品出口企業(yè)或者先進技術(shù)企業(yè)，經(jīng)營期限或投資期不少于5年的，可以全部退還其再投資部分已繳納的企業(yè)所得稅稅款。
因此，外商投資企業(yè)的外國投資者以從中國境內(nèi)的外商投資企業(yè)取得的稅后利潤，再投資于免稅項目的，如果其經(jīng)營期限或投資期限少于5年即提前終止投資項目，進入清算的，其已退的40%或全部稅款應(yīng)當繳回。
退稅額=再投資額/(1-原實際適用的企業(yè)所的稅稅率和地方所得稅稅率只和)原實際適用的企業(yè)所得稅稅率退稅率
3.地方的財政優(yōu)惠政策，如果享受優(yōu)惠政策的外商投資企業(yè)經(jīng)營期限不滿十年的，其已經(jīng)退回的的稅款也應(yīng)當在清算中交回地方政府。
4.預(yù)提費用在清算中的處理
根據(jù)《工業(yè)企業(yè)財務(wù)制度》的有關(guān)規(guī)定，生產(chǎn)型外商投資企業(yè)應(yīng)該根據(jù)中方職工的工資總額按月計提14%的職工福利費、2%的工會經(jīng)費和1.5%的職工教育經(jīng)費。其中2%的工會經(jīng)費應(yīng)該屬于工會財產(chǎn)，而不是清算財產(chǎn);而14%的職工福利費和1.5%的職工教育經(jīng)費的余額不可以當作對職工的欠款分配給公司的職工，而應(yīng)該確認為公司的收益，在清算的匯算清繳中予以調(diào)整，合并繳納所得稅。
(二)欠繳其他稅種的清理
其他稅種的欠繳一般比較少，一般為地方性的財政優(yōu)惠政策，如《浦東新區(qū)九五期間扶持外高橋保稅區(qū)經(jīng)濟發(fā)展的若干意見》中，就有對增值稅的財政返還政策。
(三)未繳稅款
對于正常經(jīng)營的企業(yè)，除了少數(shù)行為稅種如印花稅。契稅等應(yīng)該在應(yīng)稅因為發(fā)生后一段時間內(nèi)申報納稅的以外，大部分稅種都要求定期申報。因此，在清算開始后，很有可能由于沒有到申報的期限，而使外商投資企業(yè)尚余部分的稅款沒有申報、繳納。另外，對于清算之前延續(xù)下來的業(yè)務(wù)，清算期間仍然可以繼續(xù)完成，這些業(yè)務(wù)也會帶來新的稅賦。
二、清算期間的稅務(wù)事項在清算過程中還將進行資產(chǎn)處理，人員遣散安置等活動，都有可能產(chǎn)生新的稅賦。
